O comportamento de inclusão do antraceno (ANT) em três ciclodextrinas (betacyclodextrina, hidroxipropil betacyclextrin esulfobutilbetacyclodextrina) foi investigado por simulações de dinâmica molecular (MD). Os resultados do MD mostraram que a formiga poderia entrar espontaneamente nas cavidades dessas três ciclodextrinas. A diferença é que, quando embalada com sulbutilbetacclecxtrina, a formiga só pode entrar na cavidade através da borda larga da sulbutilbetacyclodextrina. Então, os efeitos de substituintes 2- hidroxipropil (hp) e butil sulfonados (SBE) na estrutura das ciclodextrinas foram estudados analisando a distorção estrutural das unidades de glicose de cada ciclodextrina.
Verificou -se que as betacyclodextrinas neutras mostraram uma estrutura cônica, e a presença de grupos HP ou SBE influenciou bastante a estrutura. A borda secundária se estreita devido ao inversão da unidade de glicose causada pela flutuação do grupo substituinte. Quando a formiga foi incluída na cavidade, a conformação da cavidade das três ciclodextrinas foi restaurada até certo ponto. Ao mesmo tempo, o grupo substituinte se estende ao longo do eixo da cavidade e interage com a molécula do hóspede.
Analisando a interação entre cada ciclodextrina e formiga, verificou -se que os grupos de substituição expandiram o volume da cavidade hidrofóbica. Tanto os grupos substituintes quanto as unidades de glicose contribuem para a interação com a molécula do hóspede. Alterações conformacionais no anel de ciclodextrina levam à contração da cavidade, o que pode permitir que ela se liga firmemente às moléculas de formiga.
